从2007年7月1日《农民专业合作社法》颁布实施以来，杭锦后旗农民专业合作社一直在持续稳步增长。截止2016年8月底，杭锦后旗在工商部门共注册农民专业合作社678家，今年新增49家。678家合作社，其中种植业合作社183家；畜牧养殖业合作社364家；种养结合合作社16家；林业合作社14家；渔业合作社3家；流通合作社 56家；加工合作社2家；服务业合作社40家，其中植保服务3 家，农机服务 36家，农产品保鲜服务1家。合作社成员发展至6020人，其中农民成员5592人，带动辐射农户4.76万户，注册资金达14.87亿元。
从合作社经营类型上看，新注册的合作社由专业化逐渐趋于种养结合多元化。今年新增49家合作社，其中种植业17家，畜牧养殖业6家，服务业10家，种养结合16家。
