文昌是海南海洋大市，拥有全省最长海岸线，天然港湾众多，其中清澜渔港和铺前渔港列为国家一级渔港和中心渔港，具有丰富的海洋水产资源。2015年，预计全市渔业总产量达到23.42万吨，同比增长8%。
海淡水养殖业是海南市农业的支柱产业，其中，文昌罗非鱼养殖规模占我省半壁江山。罗非鱼养殖分别于2005年、 2010年分别被确定为全国罗非鱼标准化示范区，2011年被国家质检总局批准为我省首家国家级出口食品农产品质量安全示范区，是全国50家国家级出口示范区之一。
热带水产苗种业一直是我市的优势产业，具有占地少，对环境影响小，单位经济效益高等优点，2014年，文昌水产苗种产量总计677亿尾，其中对虾育苗660亿尾，罗非鱼育苗9亿尾，石斑鱼育苗4500万尾，产卵2000公斤，东风螺7.5亿尾，省级水产良种场5家，占全省的三分之一，水产苗种场365家，其中海水苗种场340家，淡水苗种场25家。
海南市利用气候环境优势，大力发展热带高效水产养殖业，推广海参等新品种养殖，着重抓质量和品牌建设，发掘石斑鱼、鳗鱼、东风螺和生态鳖等发展潜力，提高价格附加值，打造适合"航天城"建设和旅游发展的热带高效水产养殖业。
